DGAP-News: Software-Upgrade von Pacific Biosciences verbessert die De-novo-Assemblierung von Genomen, das Varianten-Calling und die cDNA-Transkriptionsanalyse

Pacific Biosciences of California, Inc.

30.01.2013 00:29
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MENLO PARK, Kalifornien, 2013-01-30 00:29 CET (GLOBE NEWSWIRE) —
Pacific Biosciences of California, Inc. (Nasdaq:PACB), Anbieter des PacBio(R)
RS High Resolution Genetic Analyzer, gab heute die Veroffentlichung eines neuen
Software-Upgrades bekannt, das neben anderen wichtigen Funktionen
Genom-Assemblierungen von hoherer Qualitat mit nahezu perfekter Genauigkeit auf
der Basenebene bietet. Das Software-Upgrade erweitert den Umfang an Projekten,
die auf einzigartige Weise von der SMRT(R)-DNA-Sequenzierungsmethode (Single
Molecule, Real-Time) des Unternehmens profitieren, und wird den Kunden am 31.
Januar zum Herunterladen zur Verfugung stehen.

SMRT Analysis 1.4 umfasst einen neuen, hierarchischen
De-novo-Genomassemblierungsprozess (HGAP), der Forschern erlaubt, ganze
mikrobielle und Pilzgenome nur mit PacBio-Long-Reads zu assemblieren.
Infolgedessen konnen die Benutzer mit einer einzigen Bibliothekenpraparierung
und weniger SMRT(R)-Zellen bessere Assemblierungen als bei fruheren Ansatzen
generieren, die ausserdem Sequenzierungstechnologien mit kurzen Reads oder eine
zirkulare Konsensussequenzierung erforderten.

SMRT Analysis 1.4 enthalt zudem einen neuen Multi-Read-Konsensusalgorithmus mit
der Bezeichnung Quiver, um die fertige Genomsequenz mit aussergewohnlicher
Genauigkeit zu ermitteln. Quiver bietet sowohl fur die Resequenzierung als auch
fur die De-novo-Assemblierungsanwendungen eine Konsensusgenauigkeit von mehr
als 99,999 %.

–Die extra langen Sequenz-Reads und die sich daraus ergebende hohe Genauigkeit
der De-novo-Assemblierungen, die durch die aktuellen Softwareneuerungen von
PacBio RS erzielt werden, haben unsere Fahigkeit, neuartige Genome
kosteneffizient zu entdecken und zu verstehen, ungemein erhoht–, sagte J. Craig
Venter, Ph.D., Grunder, Vorsitzender und Chief Executive Officer am The J.
Craig Venter Institute und CEO von Synthetic Genomics.

Das Software-Upgrade unterstutzt das Analysieren von cDNA-Transkriptionen in
voller Lange, vereinfacht das Verstandnis fur die Transkription, die
Genstruktur und alternatives Spleissen. Im Gegensatz zu anderen
Sequenzierungstechnologien kann die SMRT-Sequenzierung komplette
cDNA-Transkriptionen mit einem einzigen Read umfassen, wodurch die komplette
exonische Struktur der Transkriptionen offengelegt wird.

Zu den zusatzlichen Funktionen des neuen SMRT Analysis 1.4-Upgrades gehoren:

– Unterstutzung fur die Analyse barcodierter Proben;

– Verbesserungen an den Tools zum Analysieren und Visualisieren bakterieller
Methylome, eine einzigartige Fahigkeit der SMRT-Sequenzierung;

– Erweiterte Benutzer- und Gruppenberechtigungen, damit Sequenzierungszentren
und Referenzlabore festlegen konnen, welche Daten den Endbenutzern prasentiert
werden sollen.

–Wir fuhlen uns dazu verpflichtet, die Leistung von PacBio RS kontinuierlich zu
verbessern, unter anderem auch durch Erweiterungen der Software, damit die
einzigartigen Merkmale unseres Systems noch besser zum Tragen kommen–, sagte
Kevin Corcoran, Senior Vice President des Market Development bei Pacific
Biosciences. –Durch lange Sequenz-Reads, richtungsweisende Genauigkeit und
Assemblierungen in hoherer Qualitat kann die Genom-Community uber die
SMRT-Sequenzierung die Vorteile wirklich fertiger Genome nutzen.–

Das neue Upgrade der SMRT-Analysesoftware steht zusammen mit Beispieldaten und
Protokollen fur die cDNA-Probenpraparierung und Barcodierung auf der
Community-Website von Pacific Biosciences zur Verfugung. Um auf die Software,
Daten und Dokumentation zuzugreifen, besuchen Sie www.smrtcommunity.com.

Weitere Informationen zur neuen SMRT-Analysesoftware und dem PacBio RS High
Resolution Genetic Analyzer finden Sie unter www.pacificbiosciences.com.

Uber Pacific Biosciences

Pacific Biosciences of California, Inc. (Nasdaq:PACB) hat den PacBio(R) RS High
Resolution Genetic Analyzer im Angebot, der Wissenschaftler beim Losen
genetisch komplexer Probleme unterstutzt. Basierend auf seiner neuartigen
Technologie Single Molecule, Real-Time (SMRT(R)) ermoglichen die Produkte des
Unternehmens: die gezielte Sequenzierung, um genetische Variationen umfassender
charakterisieren zu konnen; die De-novo-Assemblierung von Genomen, um
genomische Strukturen vollstandiger identifizieren, kommentieren und
entschlusseln zu konnen, sowie die DNA-basierte Identifizierung von Anderungen,
um epigenetische Regulierungen und DNA-Schaden besser charakterisieren zu
konnen. Indem Pacific Biosciences Zugang zu Informationen ermoglicht, die zuvor
nicht zuganglich waren, konnen Wissenschaftler ihr Verstandnis biologischer
Systeme verbessern.

KONTAKT: Presse:

Maurissa Messier

Fur Pacific Biosciences

+1 760.539.7417

maurissa@bioscribe.com

Investoren:

Trevin Rard

Pacific Biosciences

+1 650.521.8450

ir@pacificbiosciences.com
News Source: NASDAQ OMX

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